ICAACOnlineの学び　クロストリジウム　ディフィシール　最近の話題　＃４

「The Latest on Clostridium difficile Infection」続きます。


＃NAP1/BI/027株（NAP1と略）を発見してCDIの予後を予測できるか？
・講師はTonya Crawford先生＠ロヨラ大学。
・Case-Controlを一施設で行い、NAP1株のOutcomeを非NAP1株のそれと比較
・NAP1は高齢者、老健施設からの入院例に多い。
・必ずしも予後は悪くない。
・ちなみにNAP1株と判明したところでMetronidazoleをVancomydinに代えるわけではないが・・


＃CDIの集団発生に、どの遺伝子検査が有用か？
・講師はDavid Eyre先生＠オックスフォード大学。
・本来、集団発生の広がりを追跡するのに有用な遺伝子があると良いが。集団発生の有無にかかわらずC.diffは多くの遺伝子を共有している。だから「遺伝子A」を共有している≠集団発生の株とは言えない・・というのが背景にある。特にRibotypingという方法には限界があるとされてる。
・そこで別の方法：Multivariable-Number Tandem-Repeat Analysis（MLVA)　対　Whole Genome Sequencing（WGS)
・結論：WGSもMLVAも良い。しかし使用には専門性が必要。WGSは少しMLVAより良いが、より高価である。